林远麾下的科学家级潜艇在这场战争中并没有发挥太大的作用，在现代战争中，潜艇是反潜艇的利器，可是日本的伊型潜艇在被林远舰击败之后销声匿迹，据战后解密的资料来看：日本潜艇部队被林远舰队重创，还有一位艇长投降了林远，这两件事情让日本最高统帅部对潜艇的作用产生了怀疑，剩下的潜艇都被雪藏，不再派往朝鲜战场。
朝鲜东部海域没有了日军潜艇，林远的潜艇部队也就失去了对手，祖勇和他的同伴们每天做的事情就是在潜艇里面装满水雷，然后布设到航道上去，这让祖勇大感“英雄无用武之地”。
今天祖勇接到了海参崴舰队司令部的命令，顿时大感兴奋，带领手下操作潜艇，前往南海岛附近海域，他们刚刚驶入这片海域，声呐操作员就报告：“报告艇长，前面海域发现大量噪声，目标数量极多！”
祖勇心想：“我们肯定是碰上日军的撤退部队了！反正日本人没有反潜力量，我不如升到潜望镜高度观察一下。”想到这里祖勇高声说道：“升高到潜望镜深度！”
艇员们听见命令立刻操作升降舵，并排出水舱中的存水，潜艇很快上升到潜望镜深度度，祖勇把眼睛凑到潜望镜目镜上，把倍率调整到“1”，这个倍率不带有放大功能，所以视野最大，祖勇一看眼前的景象就惊呆了，因为眼前的视场里有三艘运输船，祖勇根据潜望镜里的标尺测算三艘船之间的距离，发现距离只有二百多米！运输船竟然排得如此的密集，说明运输船的数量绝对不少。
祖勇心中暗自担心：“恐怕我们把潜艇里的鱼雷都打光了都无法全歼这些运输船！”可是祖勇也没有办法，只能把所有鱼雷都发射出去，能击沉多少算多少了，于是祖勇高声说道：“鱼雷长，目标敌舰，发射鱼雷，注意，挑大船打！”
鱼雷长立刻答应下来，挑选最大的运输船发射了鱼雷，林远潜艇上配备的鱼雷是线导鱼雷，这种鱼雷由人发出操控指令，可以很精准地命中目标，很快一艘大型运输船就被鱼雷击中，沉入了海底。
整艘潜艇上一共携带了二十四枚鱼雷，他们很快就把鱼雷全部打光，鱼雷长向祖勇报告：“艇长，我们没有鱼雷了，可是敌人还有不少运输船呢。”
祖勇想了想说道：“咱们的艇上不是还有水雷吗？把水雷也发出去！”
鱼雷长无奈地说道：“艇长，咱们的水雷都是沉底雷，本来是要布设在南海岛的入岛航道的，可是这片海域水深超过了一百米，超过了沉底雷的容许布设极限！”
祖勇轻轻地叹了口气，说道：“如果有甲板炮就好了！可惜啊，林帅在主持潜艇的设计会议的时候把甲板炮给取消了！现在没有办法了，撤退吧。”
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